Родился в родовом имении Яшуны Виленской губернии. Его дед, Ян Снядецкий, знаменитый в свое время философ, математик, астроном. Отец, Михаил Балинский, известный историк, автор памятников «Древней Литвы».
С 1808 г. – Императорская медико-хирургическая академия; с 1881 г. – Императорская военно-медицинская академия; с 1917 г. – Военно-медицинская академия.
Иван Михайлович Балинский, отец русской психиатрии (по воспоминаниям его учеников: И. П. Мержеевского, А. Е. Черемшанского, И. А. Сикорского) // Вопросы нервно-психической медицины. 1902. T. VII. С. 1–58.
Балинский И. М. Лекции по психиатрии / Под ред. Н. И. Бондарева, Н. Н. Тимофеева. Государственное издательство медицинской литературы. Медгиз, Ленинградское отделение, 1958. 216 с. (с. 112–116).